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[正在更新] 末端终止 (截肢,P,转载请注明出处)

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发表于 2021-6-19 01:23:20 来自手机 | 显示全部楼层 |阅读模式
Phase 0 Chain-termination 末端终止

末端终止法是检测DNA序列的一种方法。其原理是利用PCR,但反应体系中除了dNTP外,还有ddNTP。ddNTP可掺入到正在延伸的DNA链中,但不能同后续的dNTP形成磷酸二酯键,从而使正在延伸的DNA链在此终止。


跑。
嘉熙的心里只剩下这个念头。
她已经有很长时间没有像现在这样地奔跑过了,更不用说是半夜在没有路灯的小巷子里奔跑。虽然对于出生在贫民区的嘉熙而言,奔跑可以说是一种本能了:这决定了你能不能抢到商店的临期商品,能不能赶在雇主等得不耐烦之前把东西送到,能不能在被混混拦住时保住身上那点可怜的家当。
但从三年前起,嘉熙就没有再像这样跑过了。汗水沿着她清秀的脸颊留下,湿漉漉的发梢黏在脸上,又被奔跑时带起的风吹开,然后再次随着脚步落下粘到脸上。心跳声响得吓人,几乎让她听不见外面的声音。呼吸声粗重得吓人,而每一次的呼吸都让她的胸口和喉咙火辣辣得疼。最让她担心的还是左小腿假肢的踝关节不时发出让人不安的响声,让她不经担心假肢会不会在这种关键时候掉链子。
嘉熙扭过头向后看去,月光下,那三个男人依旧紧紧地追在后面,似乎比刚才追得更近了一些。她又看向前方,科尔就在她前面大约五米的地方,同样也在全力奔跑着。她还能听见科尔那破旧的工装裤口袋里的那些游戏机铜板发出的叮叮当当声。他们俩逃跑的路线是一条很长的小巷,两边没有岔路也没有门之类的东西,所以两人也只能向着前方一路狂奔。所幸,巷子的尽头不是死路:从嘉熙的位置已经能看到,离他们俩大约五十米的地方,小巷就到了尽头。在巷子的外面,是一条宽阔的马路。从这里能看到,马路上的车辆和行人都不少。
“到那里就安全了,”嘉熙在心里对自己说,“那三个蠢货不敢在人多的地方动手。”
不到十秒,科尔就跑出了小巷,站在了马路的人行道上。周围的人群给了他安全感。他停下脚步,回头对嘉熙挥挥手,示意她赶紧到这里来。似乎是知道已经不可能追上,身后追逐者们也放慢了脚步。
意识到自己即将逃出生天,嘉熙一边喘着气一边挤出一个微笑。她对着前方路边的科尔伸出了手。科尔一边弯腰大口呼吸着,一边也对她伸出手。
一切仿佛就快要顺利结束了:只要嘉熙拉住科尔,两人混入街上的人群,就可以摆脱那些追逐者,然后他们就可以改头换面,去另一个安全的地方开始新的生活。
然而,事情却转向了另一个方向。
一辆没有牌照的汽车加速冲上了人行道,重重地撞在科尔身上。科尔的身体仿佛失去了重量,轻飘飘地在空着翻滚出老远,然后无力地坠落在地上。口袋里的铜板四处散落,有一个甚至滚到了嘉熙的脚旁。
嘉熙呆呆地站在原地,似乎还没弄清楚发生了什么。
她就一直这么站着,哪怕身后的三串脚步声越来越近。

——————

Phase 1 Annealing 退火

退火指模板双链DNA经热变性、双螺旋解开成单链后,通过缓慢冷却到55℃左右,使引物与该模板DNA单链重新配对,形成新的双链分子的过程。

略显空旷的小区里,路灯把两个影子拉得很长。
走在前面的是一个中年男人,略显老旧的深棕色软底皮鞋在安静的小路上发出嗒嗒的回响声。一套稍有磨损的深灰色的西装紧紧地绷在他略显肥胖的身体上,看起来有些滑稽。
跟在他身后的是一个年轻人。他比中年男人高出半头,身形厚实但不臃肿。嘴里叼着一支没有点燃的香烟,身上裹着一件黑色的长款风衣,左手把玩着一把木柄的水手刀,刀柄的一面烙刻着一个钥匙一般的标志,另一面则篆刻着“柳真”两个字,显然是他的名字。
中年男人在一幢独栋别墅前停了下来,伸手从裤子口袋里掏出一把单独放着的钥匙。他似乎很紧张,手都在发抖,试了几次才把钥匙插进门锁。
“就是这里吗?”柳真抬手取下咬在唇间还没点着的烟,转过头问那个中年男人。
“是……就是这里。”中年男人紧张地说,“这套别墅是我早些年生意好的时候买下的,之后就一直闲置在这里。”
“嗯。”柳真从风衣的口袋里摸出一个一次性的塑料打火机,点上烟吸了一口。
“后来,我生意失败,只好变卖家产,就想卖掉这处房产。”中年男人打开别墅的大门,有些害怕地向后退了一步,双眼死死地盯着门里的一片黑暗。
“然后呢,你怎么发现不对劲的?”柳真问。
“我把房子交给中介之前,想打扫一下,卖个好价钱。但是刚进门我就知道,有别人……别的东西来过了。”中年男人咽了口口水,“家具的位置被挪动过——但不是装修或者打扫卫生的那种挪动,而是被很随意地重新摆放:桌子四脚朝天,柜子放在了客厅中间,冰箱则是门朝下地放在浴室里。”
“然后呢?你就跑出来了?”柳真问。
“不,我当时以为啥附近的年轻人看这里没人居住,就撬开窗户进来玩。我楼上楼下地走遍了整个房子,也没看到一个人。所以我猜测进来的那些人已经离开了,就打算出去雇几个人一起来收拾一下烂摊子。”
中年男人深吸了一口气,仿佛回忆起了什么可怕的事情。
“可是当我回到一楼客厅,想离开这里的时候,却发现客厅里的东西位置都变了:柜子被挪到了门口,堵住了门;桌子被架在了楼梯扶手上;早就枯死的盆栽被打翻,地上全是土。但可怕的是,从我进门到准备出去的这段时间里,我完全没有听见什么异常的声音。而且我能感觉到,不管那是什么东西,它还在这间房子里。我赶紧用力挪开堵门的柜子,跑了出去。后来朋友向我介绍了您,说您擅长处理这类事情。我就筹了些钱付了定金,想请您帮我处理一下这间屋子。”
柳真点点头,扔下烟头踩灭后踢进了路边的下水道,然后走进了漆黑一片的大门。
别墅的大门后面是一个小小的玄关,转角后便是空旷的客厅。柳真打开手机的手电筒,找到了配电箱,推上电闸,灯光却没有亮起。
“一直没住这里,所以我也没交电费。”中年男人躲在柳真的身后也走了进来,有些不好意思地说。
柳真没有搭话,只是借着手机闪光灯的光线走进客厅。空气里有一股淡淡臭味,像是某种小动物留下的。客厅里的物件和中年男人刚才描述的又不大一样:空调柜机放在了正中间,角落里面朝上放着一台液晶电视,一个不知道是烘干机还是滚筒洗衣机的东西被放在了角落里。
屋子里很安静,只能听见中年男人粗重的呼吸声。柳真右手拿着手机照明,一脸漫不经心地四下里观察着,左手仍握着那把折刀,却没有把它展开。
客厅里很空旷,没什么能隐藏的地方。柳真很快就走遍了一楼。这时,二楼传来了一声东西掉落的声响。
柳真仿佛没听见楼上的动静一般,兀自绕着客厅走了一圈,然后对中年男人说:“这屋子里没什么东西,明天白天找几个人来收拾吧。”
中年男人还想说些什么,柳真做了个噤声的手势,示意他赶紧离开,同时自己也小心地慢慢向门口退去。
就在两人快要退到客厅门口时,一个黑影突然从二人上方跃下,径直扑向柳真。窗外的月光照进客厅,在黑影前方映出一抹寒光——确是黑影的一对利爪,此刻向前伸出,直取柳真咽喉。
然而柳真早有准备一般,侧身于间不容发之际躲过,利爪只在他身前擦过,在衣服上留下几道爪印。
柳真握在手中的折刀瞬间展开,趁着黑影落地,还没有转身之际,直刺黑影背后——这时候,柳真才看清黑影的外形:它的体型接近人类,拥有可以单独负重的下肢和灵活而长有利爪的上肢、直立行走跑动的能力、一条粗短的尾巴、遍布周身的黑色毛发:显然不是毳毛而是终毛、由于达尔文尖异常明显而类似于猫科动物的尖耳朵、以及显然是肉食动物专属的尖牙。
这个生物显然不是自然演化的结果,也许只能用“怪物”这个词才能描述这个仿佛是人类和美洲豹混合的动物。
折刀刺入怪物背后,它立刻怪叫一声向前逃离,并随即在客厅的角落里灵巧地转身,像一只猛兽般四肢着地蹲伏在地,口中发出威胁的呜咽,随时准备再次进攻。
柳真把折刀换到右手,刀刃向外挡在身前,然后缓缓地向怪物的方向接近。在这一人一怪之间的距离还剩两米的时候,怪物动了。
只见它的下肢瞬间绷直,用力猛蹬身下的地面,巨大的力量甚至让客厅的地板在脚下断裂开来。接着,它靠着这一蹬之力,再次化作一道黑色的孤光扑向柳真。
中年男人呆立在门口:他的动态视力已经跟不上这一人一怪的动作,只能看见在一刹那之后,两人的身体靠在了一起。
柳真闷哼一声,把怪物的爪子从自己的肚子里抽了出来——这一爪子几乎把他捅了个对穿。即便是脊椎骨挡住了爪子,他也几乎被怪物开了膛。接着,他从怪物的身上拔下折刀——刚好插在怪物的心脏上。
柳真收起折刀,用还沾着血的手从风衣口袋里掏出一块巧克力,狼吞虎咽地吃着,又用另一只手掏出手机,拨通了一个号码。
“样本已处死,可以采集。”
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渐入佳境

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发表于 2021-6-19 11:23:52 | 显示全部楼层
狠狠地给老婆鼓掌
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 楼主| 发表于 2021-6-20 09:20:41 来自手机 | 显示全部楼层
Phase 2 Real-time 真实时间

Real-TimePCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。

没过一会儿,珠兰就坐着低背轮椅来到了别墅门口。
她穿着一件白色的短款的连衣裙,长发在脑后盘成了一个发髻,鼻梁上架着一副黑色边框的眼镜。修长而白皙的双腿放在轮椅的脚踏上,膝盖上横放着一个黑色的手提箱,上面印着Shadow Felis几个龙飞凤舞的字母——正是影猫公司的快速测序分析芯片套件。
她熟练地平衡轮椅通过了别墅大门的门槛,然后打开手机的手电筒,插在连衣裙胸前的口袋里,才继续转动轮椅来到室内。
柳真在等待中抽完了第二支烟时,珠兰胸前的手电筒照亮了他。他的衣服上可以看到大片的血迹和一个巨大的破洞,但是破洞的下方并没有想象中的、足以让任何一个成年人致命的可怕伤口,而只有几道擦伤的痕迹。
“哟,”珠兰扬起一边眉毛,“又挂彩了?”
“小伤而已。”柳真淡淡地说。
“是么,”珠兰指了指柳真脚边的几个巧克力包装纸,“这可不像是什么小伤呐?”
“对我来说都一样。”柳真撇了撇嘴,“快干活吧。”
“就算你有着超出常人的代谢速度和再生能力、以及没有海弗里克极限的细胞分裂功能,这种事还是有很大隐患的。”珠兰变说边在膝盖上打开了那个手提箱。
箱子的内部结构类似老式的军用笔记本电脑:整个箱盖里是一个液晶显示屏,而箱底的一半面积被一个键盘和触控板占据,剩下的空间里放着几个类似血气分析芯片的东西和几个无菌针头及注射器。
珠兰取出一个注射器,套上针头,递给了柳真。
柳真接过空针,蹲伏到那个怪物的尸体边,仔细检查了怪物的身体之后摇摇头:“不行,时间有点长,浅静脉抽不出血了。”
珠兰又取出一个很长的针头,套在注射器上递给了柳真。
柳真结果长针头的空针,跪在怪物的身侧,深吸了一口气,沿着怪物身体的正中比划了一条线,然后从上到下摸索到没有骨头和软骨的地方——也就是所谓的剑突下方,然后倾斜着把长针头刺了进去。
针头很长,但柳真几乎把它全部刺进了怪物体内,直达它的心脏。然后,他从怪物的心脏里抽出了暗红色的血液。
接着,柳真取下针头,把注射器递给了珠兰。珠兰嫌弃地接过,把注射器插进分析芯片的上样口里,缓缓推动注射器活塞。只见分析芯片侧面的观察窗逐渐被暗红色填满,她才取下注射器,随手扔出老远。
接着,珠兰把分析芯片插进读卡器,运行了分析程序。
得益于新一代的测序技术,从全基因组中检索特定的序列变得十分快捷。还没等柳真抽完今晚的第三支烟,结果就出来了。
“多个ORF(Open reading frame,开放阅读框)的后方出现了无意义的poly TAG序列——这种无聊的东西几乎算是个写在DNA里的商标了,看来这家伙是个天键公司的基因改造试验品。”珠兰翻动着屏幕上的数据说,“我检索了基因注释数据库,这家伙应该拥有远超人类的反应速度,接近生物极限的力量,还有硬度接近碳化物陶瓷的爪子。对付这家伙可得小心点。”
“多谢你的及时提醒。”柳真指着衣服上的破洞,翻了个白眼。
“唉,真无聊,等了一晚上,结果又是一个从公司里逃出来的小白鼠。”珠兰合上手提箱,向后躺在轮椅的靠背上,“你通知‘清洁工’来处理一下现场吧,剩下的事情就和我们没关系了。”
“确实,最近这些逃出来的改造体越来越多了。”柳真掐灭了烟。
“可不,”珠兰戏谑地对着柳真比划了一下,“我这儿不就有一只超大只的在逃实验鼠。”
柳真没回答,只是下意识地用拇指摸了摸折刀刀柄上的钥匙形标记。

——————
Phase 3 Blocking 封闭

封闭(Blocking)是免疫印迹、免疫荧光等生化实验的步骤之一,通常用 5%封闭溶液(脱脂奶粉或 BSA(牛血清白蛋白))在室温下封闭膜30min - 1h,或在 4 ℃ 下封闭过夜,以抑制抗体吸附非特异性的位点。

柳真慢悠悠地走在街道上,珠兰用戴着露指手套的双手自己推着轮椅的手轮跟在他后面。夜色渐浓,气温也低了下来。柳真用手握住衣服上被爪子撕开的破洞,不让凌冽的寒风钻进衣服里。
“我说,”珠兰一边喘着气一边抬头看了看走在前面柳真,“路这么远,你也不来帮我推会儿轮椅。”
“我也挺奇怪,”柳真转过身,走到珠兰背后握住轮椅手推把,“你明明可以走路,为什么还要整天坐在轮椅上。”
“因为我喜欢这样呀。”珠兰松开手轮,双手抱胸靠在靠背上。
“诶,前面好像出事了。等等,那三个人在干什么呢?”柳真突然停了下来。
前方的人行道上,一辆没有牌照的车斜停在路中间,驾驶室的门开着,驾驶员不知所踪。车头有一块明显的凹陷。车头前方几米外,一个年轻的男孩子一动不动地趴在地上,暗红色的液体从他身下蔓延开来,逐渐淹没了散落一地的铜板。
人行道一边的巷口处,站着一个女孩,似乎已经被眼前的意外吓傻了。巷口里随即跑出来三个男人,带头的是一个戴着好几个金戒指的男人,他看了看周围,对身后的两人打了个手势。两人随即一左一右架住了路口的女孩,向巷子里拖去,而金戒指则向着倒在地上的男孩走去。
珠兰拿出手机求救,而柳真快步向三人走去。
“我受过急救培训,让我来。”柳真推开了走向男孩的金戒指,蹲在男孩身边检查呼吸和脉搏。
“别管闲事!”金戒指一把抓住柳真的衣领,把他拽了起来,然后用力推开。
柳真踉跄了两步,抬起双手示意自己没有恶意。“我只是想帮忙而已。”
突然,不远处的女孩似乎清醒了过来,一边用力地挣扎,想从那两个男人的钳制中挣脱出来,一边高声地呼救着。
金戒指见此情况,脸色一变,立即从身后掏出一把小刀,指向柳真:“当做什么都没看见,现在就走,不然……”
没等他说完,柳真就大步向前贴近,左手从外侧握住金戒指拿刀的右手手腕,右手则从他金戒指的手背处向里一推,金戒指随即不自然地松开手,小刀掉落下来。
还没等小刀着地,柳真已经抬起右膝,重重地顶在金戒指的小腹,接着重重地一拳砸在他的下巴上,金戒指应声倒了下去。
正抓着女孩的两人见此,松开女孩就向柳真扑来。柳真一脚踢开金戒指掉落在地上的小刀,迅速后退和两人拉开距离。
两人似乎碍于柳真表现出的战斗力,不敢贸然进攻。而柳真也清楚这种情况下同时对付两个人不是什么好的选择。
双方僵持之下,时间一分一秒地流逝。显然两人组没耐心一点:不管他们的目的是什么,都不会想在这种场合下过多逗留。
打破僵局的是一声闷哼。
就在柳真和二人组对峙时,一个高个子女人的身影悄无声息地从后方贴近了两人组中站位靠后的那一个。还不等那人发觉,女人便迅速地从后方用一只手臂夹住那人的脖子,另一只手臂将对方的头向前下方压去,同时整个人紧贴在他的背后。女人的手臂很强壮,紧紧地压迫着他的颈动脉窦和气管。那人在女人的裸绞下只来得及发出一声闷哼,不到十秒钟就失去了意识。
二人组里站位靠前的那个壮汉这时才转身查看。然而,这使得他把后背留给了柳真。当他发现队友倒地的同时,柳真也动了。
左腿上步起跳,随即右腿在空中后踢,右拳顺势借力向前下方猛击,一记超人拳正中那人的后脑勺。挨了脑后重击的壮汉向前踉跄扑倒,却迎上了女人的一脚低扫。不过这壮汉的体重不轻,这一下也没让他立刻倒地,但还是跪在了地面上。然而他的强韧只能让他在二人的联手下多支撑几秒钟,并给他增加了一些痛苦。
警笛声从道路尽头传来时,人行道上只剩下了趴在地上的男孩,和三个已经失去了意识的追逐者。

——————

Phase 4 Penicillin-Streptomycin 双抗

青霉素-链霉素(Penicillin-Streptomycin Solution)混合液,即“双抗”,是体外培养中为预防微生物污染最常用的抗生素。其中,青霉素能够干扰细菌细胞壁的合成,对革兰阳性菌特别有效;而链霉素能够与细菌核糖体30S亚单位结合,抑制细菌蛋白质的合成,对革兰氏阴性菌特别有效。

这是一间有些年头的居民楼。在这个时间,整栋楼也没几扇窗户还亮着灯了。和那个时代的很多居民楼一样,一楼的阳台外面是一个很小的小院子。房子的主人在院子里用有机玻璃搭了个小小的温室,里面种满了各种绿植和花卉。
此刻,小小的温室里挤着四个人。
柳真蹲在温室的角落里,无聊地打着哈欠——谈话既不是他的专长,也不算是他的兴趣。
珠兰依旧坐在轮椅上,占据了温室里的一大块空地,自顾自地翻着摊在膝盖上的一本小说。
之前差点被抓走的女孩,也就是嘉熙,正坐在温室中间的一张板凳上,左小腿的假肢已经拆了下来放在一边。她双手捧着一个茶杯——从里面多得吓人的茶叶来看,多半是珠兰给她泡的茶,正盯着茶杯一言不发。
“除了这些,你还能记得什么吗?”之前和柳真一起干掉了两个追逐者的女人跪在女孩面前,轻声询问。
女孩没说话,只是摇摇头。
“好吧,那今天就先这样。时间不早了,你也要早点休息。”女人把手搭了嘉熙的肩膀上,“对了,还没介绍一下大家呢:角落里的废柴大哥叫柳真,轮椅上的姐姐叫珠兰,我叫璇儿。你呢?你叫什么?”
“端木嘉熙。”女孩低声说,随即,她又低声说了些什么,但璇儿没听清。
“抱歉,你能说大声一点吗?我没听清。”璇儿问。
“科尔,那个男孩子叫科尔,他是我的朋友!”嘉熙突然大声说,几乎带着一点哭腔,“他是我唯一的朋友。”
看着嘉熙把头埋进膝盖,低声哽咽,璇儿凑了过去,轻轻拍了拍她,然后帮她穿好假肢,回去休息了。
“诶,为什么你让璇儿去跟她了解情况呐?你自己问她不是也挺好的?”珠兰伸脚轻轻踢了一下柳真。
“我觉得女孩子还是比较容易对小姐姐吐露心声吧。”柳真回答。
“那为什么不让我去呐?”珠兰问。
“你?”柳真撇了珠兰一眼,“就你这假小子脾气,也能算小姐姐?说不定掀起裙子来比我还大。”
“滚!”珠兰哼了一声,“谁叫你只有这么一点点小。”

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发表于 2021-6-20 14:35:27 | 显示全部楼层
这些生物学术语和小说有何关联呢?
花咲かせた、穏やかな私はもう居ない。
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